Fluorescenca pri hibridizaciji Situ
Fluorescenčna in situ hibridizacija (FISH) je ena izmed več tehnik, ki se uporabljajo za iskanje DNA celic, ki iščejo prisotnost ali odsotnost določenih genov ali delov genov.
Veliko različnih vrst raka je povezano z znanimi genetskimi nepravilnostmi. In genetsko, ne govorimo le o dednosti. V življenju lahko celice naredijo napake, ko delijo in rastejo.
Mutacije v DNA, ki so povezane z rakom, se lahko kopičijo v teh celicah.
Kako deluje FISH?
FISH je tehnika, ki uporablja fluorescentne sonde za odkrivanje specifičnih genov ali delov genov (zaporedja DNA). Osebje medicinskega laboratorija in onkologi uporabljajo FISH za pomoč pri oceni bolnikov, ki imajo raka, včasih pa tudi za spremljanje bolnika, ki je že bil diagnosticiran z rakom in zdravljen.
FISH se lahko opravi z uporabo različnih tipov vzorcev glede na lokacijo in vrsto raka, na katerega se sumi: tumorske celice, pridobljene iz periferne krvi, iz biopsije kostnega mozga ali iz biopsije limfnih vozlov in formalinskega fiksiranega parafinskega tkiva (to se nanaša na vzorec tkiva, ki se obdeluje v laboratoriju in vgrajen v vrsto voska, zaradi česar je bolj tog, tako da ga lahko rezane na tanke dele in nameščeno za ogled pod mikroskopom).
Kaj pomenijo pisma?
"H" v FISH se nanaša na hibridizacijo.
Pri molekularni hibridizaciji se kot sondo uporablja označena DNA ali RNA zaporedje - vizualizirajte rdeč Lego opeko, če hočete. Sonda se uporablja za iskanje protipožarne lege opeke ali zaporedja DNA v biološkem vzorcu.
DNK v vašem vzorcu je kot kupi Lego opeke, in večina opeke v teh kupih se ne bo ujemala z našo rdečo sondo.
Vse vaše opeke so lepo urejene v 23 parov opečnih pilotov - vsak kup je eden od vaših parnih homolognih kromosomov, bolj ali manj. Za razliko od Lego opeke, naša rdeča sonda Lego je kot močan magnet in najde svojo tekmo, ne da bi morali razvrstiti skozi kupe.
"F" se nanaša na fluorescenco. Naša rdeča sonda se lahko izgubi v kupih opek, zato je označena z barvnim fluorescenčnim barvilom, tako da bo sijalo. Ko najde svojo tekmo med 23 primerjanimi piloti, fluorescentna oznaka razkrije svojo lokacijo. Zdaj lahko vidite, kako lahko raziskovalci in zdravniki uporabljajo FISH, da pomagajo ugotoviti, kje (kateri kup ali kateri kromosom) je določen gen za posameznika.
Stojala "I" in "S" za in situ . To se nanaša na dejstvo, da naša rdeča Lego opeka išče svojo ujemanje v vzorcu, ki ste ga dali .
Kakšne specifične krvavitve?
FISH in drugi in situ hibridizacijski postopki se uporabljajo za diagnosticiranje različnih kromosomskih nepravilnosti - sprememb v genskem materialu, spremembe kromosomov, vključno z naslednjimi:
Črtanje - del kromosoma ni več
Translacija - del enega kromosoma se zlomi in se drži drugega kromosoma
Inverzija - del kromosoma se razbije in se znova vrača, vendar v obratnem vrstnem redu
Podvajanje - del kromosoma je prisoten v preveč izvodih v celici
Vsaka vrsta raka ima lahko svoj kromosomske spremembe in ustrezne sonde. FISH ne pomaga samo pri prepoznavanju začetnih genskih sprememb v bolezenskem procesu, kot je rak, ampak se lahko uporablja tudi za spremljanje odziva na terapijo in remisijo bolezni.
Genske spremembe, ki jih odkrije FISH, včasih ponujata dodatne informacije o tem, kako se bo verjetno obnašal posameznikovo rak, glede na to, kar je bilo v preteklosti opaziti pri ljudeh z enako rakom in podobnimi genetskimi spremembami. Včasih se FISH uporablja po diagnozi, ki je že bila izvedena, za pridobivanje dodatnih informacij, ki bi lahko napovedale bolnikov izid ali najboljšo zdravljenje.
FISH lahko identificira kromosomske anomalije pri levkemijah , vključno s kronično limfocitno levkemijo (CLL). Pri kronični limfocitni levkemiji / malem limfocitnem limfom FISH omogoča bolnikom, da ugotovijo svojo prognostično kategorijo: dobro, vmesno ali slabo. Pri akutni limfoblastni levkemiji (ALL) lahko genetika leukemičnih celic pove raven tveganja raka in pomaga pri usmerjanju terapevtskih odločitev.
FISH paneli so na voljo tudi za limfom, večkratni mielom, proliferativne motnje plazemskih celic in mielodisplastični sindrom. V primeru limfoma plaščnih celic, na primer, obstaja translokacija, ki jo lahko odkrije FISH, imenovan GH / CCND1 t (11; 14), ki je pogosto povezan s tem limfomom.
Zakaj FISH?
Prednost FISH je, da ga ni treba izvesti na celicah, ki se aktivno delijo. Citogenetsko testiranje običajno traja približno tri tedne, ker morajo rakave celice rasti v laboratorijskih posodah približno 2 tedna, preden se lahko testirajo. V nasprotju s tem so rezultati FISH ponavadi na voljo v laboratoriju v nekaj dneh.
> Viri:
> Cytogenetic Testiranje CTC kod.
> Fluorescenca pri hibridizaciji Situ (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Fluorescenca pri hibridizaciji Situ (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD, et al. Navodila za fluorescenco pri testiranju hibridizacije situ pri hematoloških motnjah. Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 2007; 9 (2): 134-143.